课题组聚焦合成生物学、基因编辑领域关键科学问题，解析基因编辑元件作用的分子机制，开发高精度基因编辑核酸酶，实现高精度、高效率的基因编辑；开发高通量基因组编辑策略，对理性或半理性设计的生物元件进行高通量构建、筛选以及基因型-表型的快速表征，实现对生物元器件的进化规律、催化原理、相互作用机制的系统性研究；在此基础上，将开发的合成生物学技术策略应用于构造具有特定功能的细胞工厂，实现快速、高效合成生物基化学品、生物燃料以及生物医疗产品及生物材料等，为实现合成生物学高效构建细胞工厂提供理论基础及实践范例。

主要研究方向：（1）高精度CRISPR基因编辑核酸酶的开发与应用；（2）高通量CRISPR基因组编辑工程策略开发与应用；（3）细胞工厂的功能预测与智能化设计；（4）构建细胞工厂合成生物基化学品、生物燃料、疾病诊断与治疗、细胞治疗以及高附加值产品。

课题组负责人刘嵘明教授在南京工业大学获得工学博士学位，之后进入美国科罗拉多大学博尔德分校从事博士后研究工作，并担任美国ArtisanBio生物技术公司研发科学家，2021年受聘于开云平台首页 生物工程学院、现任智能生物制造教育部重点实验室副主任。入选国家级青年人才（海外）、辽宁省兴辽英才青年拔尖人才、大连市高端人才、大连市引进中国籍海外高层次人才、江苏省优秀博士毕业论文等荣誉称号。主持科技部重点研发计划课题项目、国家级青年人才计划（海外）项目、国家自然科学基金面上项目、辽宁省兴辽英才计划青年拔尖项目、大连市科技创新基金、企业横向、中央高校基本科研业务费，参与过多项美国能源部项目（DOE）等。发表近60篇国内外学术期刊论文，以第一作者和通讯作者身份发表期刊论文 23篇，包括Nature Communications、Trends in Biotechnology、 Metabolic Engineering、 Bioresource Technology 等领域内权威期刊，英文专著篇3。以共同作者身份发表多篇包括 Science、Nature Biotechnology 等在内的权威期刊。 引用达到 1700 余次，H-index 为 25;申请及授权发明专利 10 余项，PCT专利 5 项。目前担任 Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 客座编辑以及主题编辑， Frontiers in Microbiology 杂志的评审编辑，审稿专业期刊文章 60 余篇。作为2022、2023年国际基因工程大赛（iGEM）指导老师获得2项金奖及3项单项提名奖。指导大学生创新创业项目并获得国家级立项，指导大学生获得生命科学竞赛全国二等奖及合成生物学竞赛金奖。

Selected Publications

(1) Rongming Liu; Liya Liang; Emily F. Freed; Alaksh Choudhury; Carrie A. Eckert; Ryan T. Gill*. Engineering regulatory networks for complex phenotypes in E. coli. Nature Communications, 2020, 11, 4050.

(2) Rongming Liu*; Liya Liang; Emily F. Freed; Ryan T. Gill*. Directed evolution of CRISPR/Cas systems for precise gene editing. Trends in Biotechnology, 2020, 39(3): 262-273.

(3) Rongming Liu; Liya Liang; Emily Freed; Hao Chang; Eun Joong Oh; Zeyu Liu; Andrew Garst; Carrie A. Eckert; Ryan T. Gill*. Synthetic chimeric nucleases function for efficient genome editing. Nature Communications, 2019, 10, 5524.

(4) Liya Liang; Rongming Liu (co-first author); Kyle E.O. Foster; Alaksh Choudhury; Sherri Cook; Jeffrey C. Camerona; Wil V. Srubar III; Ryan T. Gill*. Genome engineering of E. coli for improved styrene production. Metabolic Engineering, 2019, 57: 74-84.

(5) Rongming Liu; Liya Liang; Andrew D. Garst; Alaksh Choudhury; Violeta Sànchez i Nogué; Gregg T. Beckham; Ryan T. Gill*. Directed combinatorial mutagenesis of Escherichia coli for complex phenotype engineering. Metabolic Engineering, 2018, 47: 10-20.

(6) Rongming Liu; Liya Liang; Alaksh Choudhury; Marcelo C. Bassalo; Andrew D. Garst; Katia Tarasava; Ryan T. Gill*. Iterative genome editing of Escherichia coli for 3-hydroxypropionic acid production. Metabolic Engineering, 2018, 47: 303-313.

(7) Rongming Liu; Liya Liang; Alaksh Choudhury; Andrew D. Garst; Carrie A. Eckert; Eun Joong Oh; James Winkler; Ryan T. Gill*. Multiplex navigation of global regulatory networks (MINR) in yeast for improved ethanol tolerance and production. Metabolic Engineering, 2018, 51: 50-58.

(8) Andrew D Garst; Marcelo C Bassalo; Gur Pines; Sean A Lynch; Andrea L Halweg-Edwards; Rongming Liu; Liya Liang; Zhiwen Wang; Ramsey Zeitoun; William G Alexander; Ryan T Gill*. Genome-wide mapping of mutations at single-nucleotide resolution for protein, metabolic and genome engineering. Nature Biotechnology, 2017 35, 48-55.

(9) Rongming Liu; Marcelo C. Bassalo; Ramsey I. Zeitoun; Ryan T. Gill*. Genome scale engineering techniques for metabolic engineering. Metabolic Engineering, 2015, 32: 143-154.

(10) Rongming Liu; Liya Liang; Feng Li; Mingke Wu; Kequan Chen; Jiangfeng Ma; Min Jiang*; Ping Wei; Pingkai Ouyang. Efficient succinic acid production from lignocellulosic biomass by simultaneous utilization of glucose and xylose in engineered Escherichia coli. Bioresource Technology, 2013, 149: 84-91.

欢迎对合成生物学、基因组工程、代谢工程、生物化工等研究方向有兴趣的青年学者和同学加入团队
联系方式：Rongming_Liu@dlut.edu.cn